北京协和医学院是我国现代医学教育的发源地，开启了我国八年制临床医学教育和高等护理学教育的先河。在中国现代医学的各个领域，协和人或成为奠基人，或成为开拓者，在我国医学教育领域具有特殊的地位和独特的社会影响力。我校办学特色鲜明，一直坚持“高进、优教、严出”的精英培养模式，以培养具有真才实学、学风严谨、医德高尚、医术精湛的医教研复合型人才而闻名，不仅造就了林巧稚、黄家驷、吴阶平等中国医学界的泰斗，还培养了一大批享誉国内外的著名临床医学家、医学科学家、医学教育家、护理学家和医政管理家，在国内外享有很高的声誉。
我校的本科招生共有两个专业：临床医学（八年制）专业和护理专业。临床医学（八年制）专业创办于1917年，护理专业本科创办于1920年，两个专业均为国家特色专业建设点。
临床医学（八年制）专业学制8年，每年招生总数不超过90人。前2.5年为医学预科阶段，在清华大学学习普通自然科学、社会科学和人文科学课程。后5.5年为医学本科阶段，在协和本部学习基础医学和临床医学课程，完成临床实习、科研训练和毕业论文。学生毕业时成绩优秀、符合学位授予规定者可获得医学博士学位。其特色是实行“八年一贯制，本硕博融通，加强基础，注重技能，强调素质，整体优化，面向临床、科研”。
护理学本科专业学制4年，每年招生总数为150人，学生毕业时符合学位授予规定者授予理学学士学位。大多数毕业生成为护理行业的领导及骨干，为推动中国护理事业的建设和发展发挥了重要作用。至今已有7名毕业生获得国际护理学界最高荣誉“南丁格尔奖”，为我国护理院校之首冠。
为贯彻落实国务院办公厅关于加快医学教育创新发展的指导意见精神，推动医学教育与多学科融合，建设世界一流医学院，我校于2018年开始启动了临床医学专业培养模式改革试点班（以下简称“试点班”），面向全球高水平大学招收学科基础宽厚、热爱医学、个性心理特征适合学医、具备成为卓越医生潜质的优秀本科生，以培养多学科背景的高层次拔尖创新医学人才。试点班学制为4年，毕业时符合要求者授予临床医学博士（M.D.）学位。试点班的培养方案采用以模块教学为特征的医学基础教育和临床医学教育。采用多学科整合课程结构，体现基础与临床的高度融合；同时引入以学生为中心的教学理念，强调自主学习，强化实践技能培养，并实行贯穿全程的职业素养教育和学术能力构建；致力于培养思想品德高尚，具备社会担当、国际视野、创新精神和实践能力的多学科背景的复合型高层次卓越医学领军人才。
